Dworzec kolejowy położony jest w zachodniej części miasta, przy ul. Kolejowej 1.

Budynek dworca został zbudowany w XIX wieku, w związku z uruchomieniem linii kolejowej z Poznania do Szczecina. Jest to murowana, otynkowana budowla o nieregularnych kształtach.

Z Choszczna można dojechać do Aleksandrowa Kujawskiego, Białegostoku, Bydgoszczy, Częstochowy, Gliwic, Jeleniej Góry, Katowic, Krakowa, Kutna, Lublina, Łodzi, Opola, Piły, Poznania, Przemyśla, Rzeszowa, Szczecina, Świnoujścia, Tarnowa, Terespola, Torunia, Warszawy, Wrocławia, Zabrza i Zakopanego. Dostępnych jest kilkanaście połączeń dziennie. Linie są obsługiwane przez spółki PKP InterCity i PKP Przewozy Regionalne. Kasa czynna codziennie w godzinach 05:45-18:45. Kasa prowadzi sprzedaż biletów na relacje krajowe oraz z rezerwacją miejsc. W kasie nie ma możliwości płatności kartą. Budynek dworca jest przystosowany do potrzeb osób niepełnosprawnych. Poczekalnia dworcowa nie jest udostępniana całodobowo. Dostęp na perony po przejściu nadziemnym i rampie (osoby niepełnosprawne). Przed budynkiem dworca udostępniono podróżnym kilkanaście niestrzeżonych miejsc parkingowych.