Jezioro Kościelne jest położone na skraju Pojezierza Myśliborskiego, w powiecie pyrzyckim, gmina Lipiany. Sąsiaduje na północy z miejscowością Lipiany.

Razem z Jeziorem Wądół (położonym na północy miejscowości Lipiany) kiedyś było jednym akwenem wodnym (dawniej Jezioro Wedyjskie), przez co stanowiło naturalną, wodną zaporę obronną Lipian. Dzisiaj jeziora te są połączone tylko wąskim kanałem, który przebiega pod ulicą Mostową w Lipianach. Z racji swojego położenia zwane jest czasem Lipiańskim Południowym. Akwen ten ma powierzchnię 28,6 ha i głębokość maksymalną 9 m.

W wodach Kościelnego wędkarze mogą znaleźć okazy takich ryb, jak szczupaki, leszcze, liny lub płocie. Brzegi tego jeziora są porośnięte trzcinami, krzewami i drzewami. Nachylenie stoków brzegu jest łagodne, dzięki czemu dostęp do wody jest bardzo łatwy praktycznie z każdego miejsca.