Jezioro Czernikowskie znajduje się w powiecie myśliborskim, w gminie Myślibórz, na terenie Pojezierza Myśliborskiego, na południe od Tchórzna, południowy zachód od Sarbinowa oraz na północ od Pniowa.

Na wschodnim brzegu jeziora leży miejscowość Czerników. Na południowy zachód od jeziora znajduje się rezerwat przyrody Długogóry.

Jezioro otoczone jest drogami lokalnymi łączącymi m.in. Czerników z Tchórznem.

Jezioro Czernikowskie zajmuje powierzchnię 72,5 ha. Jego średnia głębokość wynosi 5,9 m, zaś maksymalna 11,2 m.
Akwen ten otoczony jest przede wszystkim malowniczymi polami uprawnymi. Brzegi porastają szuwary, w których pasie znajdują się jednak przerwy umożliwiając dostęp do wody.

Według typologii wędkarskiej jest to jezioro sandaczowe jednak złowić tutaj można również leszcza, okonia, płoć oraz szczupaka.