Mała Gunica wypływa z małego, wysychającego jeziora Lipka, nieopodal miejscowości Lubieszyn, przy granicy z Niemcami. Rzeka płynie na północ, przez Dobrą i wpada do jeziora Świdwie. 

Rzeka Mała Gunica jest najdłuższą rzeką w Gminie Dobra. Wypływając z okolic Lubieszyna przepływa przez teren rozlewiskowy, podążając aż do Dobrej. Mijając Dobrą płynie dalej przez rozlewiska i szeroką doliną zmierza na północ. W okolicy Węgornika wpada do rzeki Gunicy, z wodami której uchodzi do jeziora Świdwie.